Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A2

CYP46A1, Cholesterol 24-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP46A1Q9Y6A2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CYP46A1Q9Y6A2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CYP46A1Q9Y6A2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CYP46A1Q9Y6A2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP46A1Q9Y6A2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms