Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J1

UTP18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-216ENST00000592445 598 ntTSL 219.97■□□□□ 0.791e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-203ENST00000586486 1613 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.531e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.521e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.11e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-202ENST00000585540 501 ntTSL 314.73□□□□□ -0.051e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 PRKCSH-201ENST00000585325 598 ntTSL 413.97□□□□□ -0.171e-8■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.114e-13■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 HSP90AA1-202ENST00000334701 3510 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-13■■□□□ 13
UTP18Q9Y5J1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.295e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.595e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 SMC1A-204ENST00000463684 880 ntTSL 214.69□□□□□ -0.065e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.185e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.255e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.99e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.419e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 215.39■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.9
UTP18Q9Y5J1 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.074e-9■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.961e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)17.83■□□□□ 0.441e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)15.18■□□□□ 0.021e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt15.15■□□□□ 0.021e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 212.42□□□□□ -0.421e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 510.15□□□□□ -0.781e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-215ENST00000490753 640 ntTSL 29.81□□□□□ -0.841e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 29.18□□□□□ -0.941e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 58.79□□□□□ -11e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-211ENST00000471023 592 ntTSL 27.94□□□□□ -1.141e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 NOP56-212ENST00000480447 651 ntTSL 26.44□□□□□ -1.381e-19■■□□□ 12.8
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 415.2■□□□□ 0.029e-22■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-210ENST00000508003 582 ntTSL 211.88□□□□□ -0.519e-22■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.72□□□□□ -1.979e-22■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-221ENST00000560451 5124 ntTSL 1 (best)22.08■■□□□ 1.131e-6■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.551e-6■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 MAN2A2-204ENST00000558161 4918 ntTSL 1 (best)13.68□□□□□ -0.221e-6■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.215e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.985e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.825e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-225ENST00000585084 997 ntTSL 329.75■■■□□ 2.352e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.912e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-223ENST00000584229 535 ntTSL 326.78■■□□□ 1.882e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.792e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-214ENST00000581418 580 ntTSL 219.56■□□□□ 0.722e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-221ENST00000583961 581 ntTSL 518.89■□□□□ 0.612e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-209ENST00000578642 579 ntTSL 418.89■□□□□ 0.612e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-216ENST00000582327 561 ntTSL 418.47■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 418.47■□□□□ 0.552e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.512e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 218.09■□□□□ 0.492e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 417.53■□□□□ 0.42e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 417.22■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 216.35■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-211ENST00000580627 543 ntTSL 416.35■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-203ENST00000392357 4076 ntTSL 1 (best)15.37■□□□□ 0.052e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-215ENST00000581578 470 ntTSL 413.91□□□□□ -0.182e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-217ENST00000583009 574 ntTSL 413.1□□□□□ -0.312e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 GPS1-220ENST00000583885 594 ntTSL 413.01□□□□□ -0.332e-7■■□□□ 12.7
UTP18Q9Y5J1 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.7□□□□□ -1.984e-8■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.322e-9■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 GREB1-204ENST00000381486 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.322e-9■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.632e-9■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 GREB1-202ENST00000263834 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-9■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.451e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-210ENST00000629042 3054 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.241e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-208ENST00000583931 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-203ENST00000436748 1339 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.961e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.31e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.671e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-207ENST00000534437 616 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.991e-6■■□□□ 12.6
UTP18Q9Y5J1 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 215.29■□□□□ 0.048e-8■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 519.02■□□□□ 0.646e-7■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 416.14■□□□□ 0.176e-7■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.469e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.339e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.049e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 214.38□□□□□ -0.119e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 211.82□□□□□ -0.529e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.74□□□□□ -0.699e-16■■□□□ 12.5
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 524■■□□□ 1.435e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.995e-7■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-205ENST00000467980 899 ntTSL 328.24■■■□□ 2.115e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.965e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-206ENST00000469309 910 ntTSL 225.71■■□□□ 1.715e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-215ENST00000495535 672 ntTSL 325.11■■□□□ 1.615e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-219ENST00000522266 480 ntTSL 225.11■■□□□ 1.615e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.415e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.345e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 FGFR4-213ENST00000511076 838 ntTSL 520.9■□□□□ 0.945e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.915e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-207ENST00000473391 1064 ntTSL 220.53■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-213ENST00000488943 1262 ntTSL 520.52■□□□□ 0.885e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-208ENST00000475514 1192 ntTSL 520.51■□□□□ 0.875e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.835e-6■■□□□ 12.4
UTP18Q9Y5J1 TCF25-207ENST00000562256 1879 ntTSL 1 (best)20.24■□□□□ 0.831e-6■■□□□ 12.4
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