RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585084.5

GPS1-225, Transcript of G protein pathway suppressor 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPS1, Length 997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1-225ENST00000585084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa70.64■■■■■ 8.9
GPS1-225ENST00000585084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa63.21■■■■■ 7.71
GPS1-225ENST00000585084 ABCC9O60706 1549 aa62.88■■■■■ 7.66
GPS1-225ENST00000585084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.03■■■■■ 7.2
GPS1-225ENST00000585084 NACADO15069 1562 aa59.7■■■■■ 7.15
GPS1-225ENST00000585084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa59.6■■■■■ 7.13
GPS1-225ENST00000585084 MYO15BQ96JP2 1530 aa58.98■■■■■ 7.03
GPS1-225ENST00000585084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.62■■■■■ 6.971e-6■■□□□ 11.7
GPS1-225ENST00000585084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP58.61■■■■■ 6.97
GPS1-225ENST00000585084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa58.59■■■■■ 6.97
GPS1-225ENST00000585084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.58■■■■■ 6.97
GPS1-225ENST00000585084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa58.37■■■■■ 6.94
GPS1-225ENST00000585084 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.18■■■■■ 6.9
GPS1-225ENST00000585084 SCRIBQ14160 1630 aa57.64■■■■■ 6.82
GPS1-225ENST00000585084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.51■■■■■ 6.8
GPS1-225ENST00000585084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.8■■■■■ 6.68
GPS1-225ENST00000585084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.77■■■■■ 6.68
GPS1-225ENST00000585084 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.61■■■■■ 6.65
GPS1-225ENST00000585084 NCAPD3P42695 1498 aa55.11■■■■■ 6.41
GPS1-225ENST00000585084 SMARCA4P51532 1647 aa55.01■■■■■ 6.4
GPS1-225ENST00000585084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa54.98■■■■■ 6.39
GPS1-225ENST00000585084 SMARCA2P51531 1590 aa54.89■■■■■ 6.38
GPS1-225ENST00000585084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP54.83■■■■■ 6.37
GPS1-225ENST00000585084 HMGXB3Q12766 1538 aa54.72■■■■■ 6.35
GPS1-225ENST00000585084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP54.51■■■■■ 6.32
GPS1-225ENST00000585084 PEG3Q9GZU2 1588 aa54.46■■■■■ 6.31
GPS1-225ENST00000585084 MROH2BQ7Z745 1585 aa54.42■■■■■ 6.3
GPS1-225ENST00000585084 ERCC6Q03468 1493 aa54.31■■■■■ 6.28
GPS1-225ENST00000585084 NESP48681 1621 aa54.09■■■■■ 6.25
GPS1-225ENST00000585084 CUX2O14529 1486 aa54.04■■■■■ 6.24
GPS1-225ENST00000585084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa53.81■■■■■ 6.2
GPS1-225ENST00000585084 WIZO95785 1651 aa53.79■■■■■ 6.2
GPS1-225ENST00000585084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.59■■■■■ 6.17
GPS1-225ENST00000585084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.53■■■■■ 6.16
GPS1-225ENST00000585084 CADPSQ9ULU8 1353 aa53.48■■■■■ 6.15
GPS1-225ENST00000585084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP53.45■■■■■ 6.15
GPS1-225ENST00000585084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
GPS1-225ENST00000585084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.4■■■■■ 6.14
GPS1-225ENST00000585084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP53.16■■■■■ 6.1
GPS1-225ENST00000585084 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.01■■■■■ 6.08
GPS1-225ENST00000585084 CFTRP13569 1480 aa52.92■■■■■ 6.06
GPS1-225ENST00000585084 CEP164Q9UPV0 1460 aa52.89■■■■■ 6.06
GPS1-225ENST00000585084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa52.86■■■■■ 6.05
GPS1-225ENST00000585084 WDR62O43379 1518 aa52.83■■■■■ 6.05
GPS1-225ENST00000585084 CCDC88BA6NC98 1476 aa52.56■■■■■ 6
GPS1-225ENST00000585084 PRDM2Q13029 1718 aa52.4■■■■■ 5.98
GPS1-225ENST00000585084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.36■■■■■ 5.97
GPS1-225ENST00000585084 TOPBP1Q92547 1522 aa51.89■■■■■ 5.9
GPS1-225ENST00000585084 ABCC8Q09428 1581 aa51.85■■■■■ 5.89
GPS1-225ENST00000585084 IFT140Q96RY7 1462 aa51.82■■■■■ 5.89
GPS1-225ENST00000585084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa51.73■■■■■ 5.87
GPS1-225ENST00000585084 OSCARQ8IYS5 282 aa51.7■■■■■ 5.87
GPS1-225ENST00000585084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.65■■■■■ 5.86
GPS1-225ENST00000585084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.48■■■■■ 5.83
GPS1-225ENST00000585084 TRIM41Q8WV44 630 aa51.45■■■■■ 5.83
GPS1-225ENST00000585084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.39■■■■■ 5.82
GPS1-225ENST00000585084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP51.38■■■■■ 5.82
GPS1-225ENST00000585084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP51.36■■■■■ 5.81
GPS1-225ENST00000585084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.27■■■■■ 5.8
GPS1-225ENST00000585084 SOGA1O94964 1423 aa51.2■■■■■ 5.79
GPS1-225ENST00000585084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa51.18■■■■■ 5.78
GPS1-225ENST00000585084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa51.12■■■■■ 5.77
GPS1-225ENST00000585084 CUX1P39880 1505 aa51.11■■■■■ 5.77
GPS1-225ENST00000585084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.04■■■■■ 5.76
GPS1-225ENST00000585084 FBLN2P98095 1184 aa50.95■■■■■ 5.75
GPS1-225ENST00000585084 CHD1O14646 1710 aa50.93■■■■■ 5.74
GPS1-225ENST00000585084 WDR97A6NE52 1622 aa50.91■■■■■ 5.74
GPS1-225ENST00000585084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa50.89■■■■■ 5.74
GPS1-225ENST00000585084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa50.89■■■■■ 5.74
GPS1-225ENST00000585084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa50.89■■■■■ 5.74
GPS1-225ENST00000585084 ARHGEF11O15085 1522 aa50.79■■■■■ 5.72
GPS1-225ENST00000585084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa50.75■■■■■ 5.71
GPS1-225ENST00000585084 GRIN2BQ13224 1484 aa50.7■■■■■ 5.71
GPS1-225ENST00000585084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP50.65■■■■■ 5.7
GPS1-225ENST00000585084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.63■■■■■ 5.7
GPS1-225ENST00000585084 GAPVD1Q14C86 1478 aa50.57■■■■■ 5.69
GPS1-225ENST00000585084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa50.57■■■■■ 5.69
GPS1-225ENST00000585084 SYNJ2O15056 1496 aa50.48■■■■■ 5.67
GPS1-225ENST00000585084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP50.48■■■■■ 5.67
GPS1-225ENST00000585084 PBRM1Q86U86 1689 aa50.47■■■■■ 5.67
GPS1-225ENST00000585084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa50.46■■■■■ 5.67
GPS1-225ENST00000585084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa50.42■■■■■ 5.66
GPS1-225ENST00000585084 SYNJ1O43426 1573 aa50.42■■■■■ 5.66
GPS1-225ENST00000585084 TOP2BQ02880 1626 aa50.41■■■■■ 5.66
GPS1-225ENST00000585084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa50.4■■■■■ 5.66
GPS1-225ENST00000585084 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.35■■■■■ 5.65
GPS1-225ENST00000585084 ARAP1Q96P48 1450 aa50.3■■■■■ 5.64
GPS1-225ENST00000585084 GRIN2AQ12879 1464 aa50.02■■■■■ 5.6
GPS1-225ENST00000585084 ADAMTS12P58397 1594 aa50.02■■■■■ 5.6
GPS1-225ENST00000585084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa49.95■■■■■ 5.59
GPS1-225ENST00000585084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa49.95■■■■■ 5.59
GPS1-225ENST00000585084 NUP160Q12769 1436 aa49.83■■■■■ 5.57
GPS1-225ENST00000585084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP49.82■■■■■ 5.57
GPS1-225ENST00000585084 CEP170Q5SW79 1584 aa49.79■■■■■ 5.56
GPS1-225ENST00000585084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa49.58■■■■■ 5.53
GPS1-225ENST00000585084 SHROOM2Q13796 1616 aa49.53■■■■■ 5.52
GPS1-225ENST00000585084 KIF27Q86VH2 1401 aa49.5■■■■■ 5.51
GPS1-225ENST00000585084 IGF1RP08069 1367 aa49.41■■■■■ 5.5
GPS1-225ENST00000585084 JPH4Q96JJ6 628 aa49.39■■■■■ 5.5
GPS1-225ENST00000585084 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP49.36■■■■■ 5.49
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