Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E3

PCDHB6, Protocadherin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB6Q9Y5E3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB6Q9Y5E3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB6Q9Y5E3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHB6Q9Y5E3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB6Q9Y5E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms