Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRC42Q9Y546 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRC42Q9Y546 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRC42Q9Y546 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms