Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAN1Q9Y2M0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAN1Q9Y2M0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAN1Q9Y2M0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAN1Q9Y2M0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms