Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y294

ASF1A, Histone chaperone ASF1A, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1AQ9Y294 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ASF1AQ9Y294 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ASF1AQ9Y294 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ASF1AQ9Y294 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms