Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RNF6Q9Y252 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RNF6Q9Y252 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RNF6Q9Y252 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms