Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMC3Q9UQE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMC3Q9UQE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMC3Q9UQE7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms