Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMPRSS11EQ9UL52 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMPRSS11EQ9UL52 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMPRSS11EQ9UL52 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TMPRSS11EQ9UL52 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms