Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SEPT3Q9UH03 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEPT3Q9UH03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEPT3Q9UH03 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEPT3Q9UH03 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.5 ms