Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TCF20Q9UGU0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TCF20Q9UGU0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TCF20Q9UGU0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TCF20Q9UGU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms