Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
REV1Q9UBZ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REV1Q9UBZ9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REV1Q9UBZ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms