Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CTSFQ9UBX1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CTSFQ9UBX1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CTSFQ9UBX1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms