Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PSD3Q9NYI0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PSD3Q9NYI0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSD3Q9NYI0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSD3Q9NYI0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms