Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX70

MED29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED29Q9NX70 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED29Q9NX70 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED29Q9NX70 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED29Q9NX70 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED29Q9NX70 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms