Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCM2LQ9NUG4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCM2LQ9NUG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms