Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRDM8Q9NQV8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRDM8Q9NQV8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRDM8Q9NQV8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms