Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASS4Q9NQ75 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASS4Q9NQ75 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASS4Q9NQ75 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms