Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ31

AKIP1, A-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKIP1Q9NQ31 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AKIP1Q9NQ31 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
AKIP1Q9NQ31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
AKIP1Q9NQ31 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms