Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HIPK3Q9H422 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HIPK3Q9H422 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HIPK3Q9H422 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HIPK3Q9H422 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms