Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
CFAP74Q9C0B2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
CFAP74Q9C0B2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CFAP74Q9C0B2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CFAP74Q9C0B2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CFAP74Q9C0B2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CFAP74Q9C0B2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms