Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
KRTAP9-3Q9BYQ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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KRTAP9-3Q9BYQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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