Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DDA1Q9BW61 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DDA1Q9BW61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DDA1Q9BW61 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
DDA1Q9BW61 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms