Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TMEM106CQ9BVX2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TMEM106CQ9BVX2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TMEM106CQ9BVX2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TMEM106CQ9BVX2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms