Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIOK2Q9BVS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIOK2Q9BVS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIOK2Q9BVS4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIOK2Q9BVS4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms