Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GINS3Q9BRX5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
GINS3Q9BRX5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
GINS3Q9BRX5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms