Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CPPED1Q9BRF8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPPED1Q9BRF8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPPED1Q9BRF8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPPED1Q9BRF8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms