Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GORASP1Q9BQQ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GORASP1Q9BQQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
GORASP1Q9BQQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GORASP1Q9BQQ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms