Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPAS2Q99743 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NPAS2Q99743 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NPAS2Q99743 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NPAS2Q99743 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms