Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RAD9AQ99638 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RAD9AQ99638 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RAD9AQ99638 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RAD9AQ99638 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118 ms