Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SCAF11Q99590 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SCAF11Q99590 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SCAF11Q99590 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SCAF11Q99590 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
SCAF11Q99590 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms