Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RUFY1Q96T51 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RUFY1Q96T51 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RUFY1Q96T51 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RUFY1Q96T51 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms