Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUDCD1Q96RS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NUDCD1Q96RS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NUDCD1Q96RS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUDCD1Q96RS6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUDCD1Q96RS6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms