Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN8

TSSK3, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK3Q96PN8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSSK3Q96PN8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSSK3Q96PN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSSK3Q96PN8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TSSK3Q96PN8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms