Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT4

LINC01600, Uncharacterized protein encoded by LINC01600, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01600Q96MT4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LINC01600Q96MT4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC01600Q96MT4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01600Q96MT4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms