Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C3orf30Q96M34 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf30Q96M34 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf30Q96M34 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.6 ms