Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINC00615Q96LM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LINC00615Q96LM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LINC00615Q96LM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms