Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRIG1Q96JA1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRIG1Q96JA1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRIG1Q96JA1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRIG1Q96JA1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms