Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
ABCC11Q96J66 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ABCC11Q96J66 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
ABCC11Q96J66 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ABCC11Q96J66 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ABCC11Q96J66 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms