Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OTUB1Q96FW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
OTUB1Q96FW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
OTUB1Q96FW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1374.3 ms