Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINGO1Q96FE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LINGO1Q96FE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LINGO1Q96FE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LINGO1Q96FE5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms