Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
EDC3Q96F86 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
EDC3Q96F86 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
EDC3Q96F86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EDC3Q96F86 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms