Protein–RNA interactions for Protein: Q96DI7

SNRNP40, U5 small nuclear ribonucleoprotein 40 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP40Q96DI7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SNRNP40Q96DI7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRNP40Q96DI7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRNP40Q96DI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRNP40Q96DI7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms