Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
DHX58Q96C10 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DHX58Q96C10 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DHX58Q96C10 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DHX58Q96C10 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms