Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3KBP1Q96B97 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3KBP1Q96B97 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3KBP1Q96B97 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms