Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC47Q96A33 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC47Q96A33 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC47Q96A33 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC47Q96A33 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms