Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNPO1Q92973 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TNPO1Q92973 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TNPO1Q92973 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms