Protein–RNA interactions for Protein: Q92903

CDS1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1Q92903 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDS1Q92903 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDS1Q92903 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDS1Q92903 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms