Protein–RNA interactions for Protein: Q92738

USP6NL, USP6 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6NLQ92738 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
USP6NLQ92738 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
USP6NLQ92738 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP6NLQ92738 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP6NLQ92738 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms